From: Automated macrophage counting in DLBCL tissue samples: a ROF filter based approach
(S1) | (S2) | (S3) | (S4) | (S5) | (S6) | |
---|---|---|---|---|---|---|
Software type | ||||||
proprietary | ∙ | ∙ | ||||
freeware extension of proprietary | ∙ | ∙ | ||||
freeware | ∙ | ∙ | ||||
Input | ||||||
.png format | ∙ | ∙ | ∙ | ∙ | ∙ | ∙ |
.ndpi(s) format | ∙ | ∙ | ||||
Output | ||||||
count | ∙ | ∙ | ||||
area | ∙ | ∙ | ∙ | ∙ | ||
annotated image | ∙ | ∙ | ∙ | ∙ | ||
feature mask | ∙ | ∙ | ∙ | ∙ | ||
logfile | ∙ | ∙ | ||||
Evaluation subregion | ||||||
prescribed | ∙ | ∙ | ||||
manual detection | ∙ | |||||
automated detection | ∙ | ∙ | (∙) | |||
Threshold adaptation | ||||||
manually | ∙ | ∙ | ||||
automated | ∙ | ∙ | n/a | n/a | ||
Feature detection | ||||||
none | ∙ | ∙ | ||||
rule-based | ∙ | ∙ | ||||
by training set | ∙ | ∙ |